國務院批準實施《全國海洋主體功能區規劃》（國發【2015】42號）（以下簡稱《規劃》），使國家主體功能區戰略實現了陸域國土空間和海域國土空間 全覆蓋。《規劃》提出，到2020年主體功能區布局基本形成，實現海洋空間利用格局清晰合理、海洋空間利用效率提高、海洋可持續發展能力提升。其中，針對 不同的海洋空間劃分，《規劃》對港口資源整合及功能調整做出了部署。
《規劃》針對內水和領海、專屬經濟區和大陸架及其他管轄海域等的不同特點，根據不同海域資源環境承載能力、現有開發強度和發展潛力，將海洋空間劃分為優化開發區域、重點開發區域、限制開發區域和禁止開發區域。
在港口資源整合及功能調整方面，《規劃》明確的優化開發區域為渤海灣、長江口及其兩翼、珠江口 及其兩翼、北部灣、海峽西部以及遼東半島、山東半島、蘇北、海南島附近海域，要加強布局合理、優勢互補、協調發展的港口群建設。此外，這類功能區還涉及了 三個“航運中心“建設，分別為：遼東半島海域，包括遼寧省丹東市、大連市、營口市、盤錦市、錦州市、葫蘆島市毗鄰海域，要加快建設大連東北亞國際航運中 心；渤海灣海域，包括河北省秦皇島市、唐山市、滄州市和天津市毗鄰海域，要推動天津北方國際航運中心建設；長江口及其兩翼海域，包括江蘇省南通市、上海市 和浙江省嘉興市、杭州市、紹興市、寧波市、舟山市、臺州市毗鄰海域，要整合長三角港口資源，推動港口功能調整升級，發展現代航運服務體系，提高上海國際航 運中心整體水平。
針對其他的海域空間，《規劃》要求，重點開發區域的港口和臨港產業用海應滿足國家區域發展戰略 要求，合理布局，促進臨港產業集聚發展；控制建設規模，防止低水平重復建設和產業結構趨同化；嚴格環境準入，禁止占用和影響周邊海域旅游景區、自然保護 區、河口行洪區和防洪保留區等。限制開發區域的重要河口區域，禁止采挖海砂、圍填海等破壞河口生態功能的開發活動。在禁止開發區域，海洋基礎設施建設原則 上不得穿越自然保護區，涉及保護區的航道、管線和橋梁等基礎設施經嚴格論證并批準后方可實施。